Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hoxb1P17919 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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