Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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