Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms