Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms