Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms