Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PolP10400 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PolP10400 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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