Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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