Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04214 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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P04214 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04214 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04214 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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