Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a1P02463 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a1P02463 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms