Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copb2O55029 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms