Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NlkO54949 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms