Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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