Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms