Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms