Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcshO08795 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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