Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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