Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MsmbO08540 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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