Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm379J3QQ19 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms