Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms