Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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