Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21863J3KMP8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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