Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm5861F6VCN9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm5861F6VCN9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm5861F6VCN9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5861F6VCN9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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