Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17727E9Q4V7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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