Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms