Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myo5cE9Q1F5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms