Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Samd1D3YXK1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Samd1D3YXK1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms