Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms