Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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