Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Prr16A3KMN5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr16A3KMN5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms