Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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