Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc183A2AJB1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms