Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb4A2A863 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms