Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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