Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms