Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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