Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms