Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nphs1Q9QZS7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nphs1Q9QZS7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nphs1Q9QZS7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nphs1Q9QZS7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nphs1Q9QZS7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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