Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gpc1Q9QZF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gpc1Q9QZF2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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