Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms