Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3b2Q9JME5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms