Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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