Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hmgn5Q9JL35 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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