Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms