Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gfra4Q9JJT2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gfra4Q9JJT2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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