Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms