Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms