Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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