Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms