Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ftsj3Q9DBE9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ftsj3Q9DBE9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms