Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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